巍山县境内有多处玉皇阁，但以巍宝山的玉皇阁最为壮观。原明代晚期的玉皇阁位置在三皇殿左下方，清乾隆十三年(公元1748年)重建时迁移到今天的新地址，在灵官殿的背后。玉皇阁依山而建，层层而上，每层以三路石级相通，共42级，由四圣殿、三师殿、三官殿、吕祖殿、依云阁、弥罗上宫(圣父母殿)等组成，是巍宝山所有殿宇中规模最大、建筑年代最早的殿宇，内供奉天地水三官、吕祖、财神等。玉皇殿内玉皇大帝塑像的天花板上绘有十幅彩色图案，其中九幅是彩龙图，另一幅是著名的道家“水火匡廓图”，具有很高的宗教研究价值。

“水火匡廓图”采用黑白两种颜色绘制，用宽细线条合半交错的手法绘成，既不同于太极图，也不同于八卦图。它源于后汉(公元947年—95 0年)巍伯阳所著的《周易参同契》，是道士妄想修炼长生不老丹的药方示意图。后来产生的 太极图就是在“水火匡廓图”和“三五至精图”的基础上合成的。唐代四川青城山天师派道教哲学家彭晓曾批注《参同契》，将“水火匡廓图”解释为“明镜图”。

这幅绘制于清乾隆十三年(公元1748年)距今200余年的“水火匡廓图”标志着巍宝山很早就是中国南方五斗米道的传教区之一，也说明了巍宝山道教与四川青城山道教的文化联系，为研究巍宝山道教的起源和派别提供了可贵的资料。

玉皇阁坐落于保山西郊太保山山麓，属明代三层门拱建筑，工艺精湛，气势雄伟。玉皇阁左右各建八角式钟亭一座，又名“全真楼”，明代旅行家徐霞客到保山时曾住于此。 玉皇阁北端比邻玉佛寺，寺内供奉多尊玉佛，近年在玉皇阁建有保山市博物馆。

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